Магистратура 2025/2026

Введение в популяционную генетику и эволюция методов оценки племенной ценности

Статус: Курс обязательный (Биоинформатика в агробиотехнологиях)

Кто читает: Институт аграрных исследований

Когда читается: 1-й курс, 2 модуль

Охват аудитории: для своего кампуса

Язык: русский

Контактные часы: 40

Программа дисциплины

Аннотация

Эволюция методов оценки племенной ценности сельскохозяйственных животных. Современное состояние и система оценки генотипа особей в России. Методы ANOVA / MANOVA для определения изменчивости количественных признаков, силы влияния средовых и генетических факторов, включенных в модель. Наилучший линейный несмещенный прогноз (базовые принципы: BLUP Sire Model, Animal Model). Селекционный индекс как метода отбора животных по комплексу признаков. Конструирование селекционного индекса на примере молочного скотоводства: принципы и последовательность построения. Международная система генетической оценки быков – INTERBULL. Прикладные аспекты использования данных полногеномного SNP-генотипирования в решении задач животноводства. Особенности подготовки данных полногеномного SNP-генотипирования для анализа в зависимости от задач исследований. Оценка генетической структуры популяции и параметров генетического разнообразия в популяции (выборке) животных на основании данных полногеномного SNP-генотипирования. Анализ многомерного шкалирования (главных компонент) для оценки генетической вариабельности, оценка результатов адмиксии и ее практическое использование. Паттерны гомозиготности: анализ количества и длин фрагментов, оценка геномного инбридинга, оценка мультилокусной гетерозиготности. Принципы и методы структурной аннотации полиморфизмов (идентификация генов) у сельскохозяйственных животных. Полногеномные ассоциативные исследования (GWAS): теоретические и практические аспекты. Формирование списков генов для аннотации по результатам различных анализов (поиск локусов под давлением, GWAS). Геномная селекция животных: от фенотипа к генотипу. Референтная популяция: принципы формирования. Обработка генетической информации для использования в племенной работе (геномная оценка).