Магистратура
2025/2026
Биоинформатические методы в исследованиях происхождения
Статус:
Курс по выбору (Анализ данных в биологии и медицине)
Где читается:
Факультет компьютерных наук
Когда читается:
1-й курс, 4 модуль
Охват аудитории:
для всех кампусов НИУ ВШЭ
Язык:
русский
Кредиты:
3
Контактные часы:
40
Программа дисциплины
Аннотация
Дисциплина преподается с целью освоения теоретических основ и практических методов анализа геномных данных, охватывающих популяционную генетику, моделирование демографической истории, родственных и филогенетических связей, а также в интерпретации адаптивных и функциональных аспектов геномных данных.
Цель освоения дисциплины
- Формирование у обучающихся целостного понимания принципов, методов и приложений популяционной и эволюционной геномики, развитие компетенций в анализе генетического разнообразия, демографической истории, родственных и филогенетических связей, а также в интерпретации адаптивных и функциональных аспектов геномных данных.
Планируемые результаты обучения
- Приобретение и закрепление знаний в области современных генетических технологий в персонализированной медицине, усвоенных в рамках занятий
- Знать теоретические основы популяционной генетики, включая модели Харди–Вайнберга, процессы дрейфа, отбора, миграции и мутаций
- Знать подходы к оценке отбора, адаптации и происхождения геномов
- Знать основы интеграции популяционных, функциональных и древних геномных данных
- Знать методы фазирования и импьютинга генетических данных, оценки родства, происхождения и генетической структуры популяций
- Знать методы анализа генетической структуры, родства, филогенетических и демографических связей
Содержание учебной дисциплины
- Основы популяционной генетики
- Фазирование и импьютация генетических данных
- Методы снижения размерности и визуализация генетических данных
- Поиск родства и идентификация родственных связей
- Филогенетический анализ и реконструкция родословных
- Оценка происхождения индивидуального генома
- Анализ митохондриальных и Y-хромосомных гаплогрупп
- Анализ древней ДНК
Список литературы
Рекомендуемая основная литература
- 9781119429227 - Balding, D. J.; Moltke, Ida; Marioni, John - Handbook of Statistical Genomics - 2019 - John Wiley & Sons - http://search.ebscohost.com/login.aspx?direct=true&db=nlebk&AN=2182931 - nlebk - 2182931
- Handbook of statistical genomics. Vol. 1: ., , 2019
- Handbook of statistical genomics. Vol. 2: ., , 2019
Рекомендуемая дополнительная литература
- John H. Relethford. (2012). Human Population Genetics. Wiley-Blackwell.