2025/2026
Медицинская биоинформатика
ID 942803
Лучший по критерию «Новизна полученных знаний»
Статус:
Майнор
Где читается:
Факультет компьютерных наук
Охват аудитории:
для всех кампусов НИУ ВШЭ
Язык:
русский
Кредиты:
5
Контактные часы:
76
Программа дисциплины
Аннотация
В курсе “Медицинская биоинформатика” изучается геномика человека, полиморфизмы и структурные варианты в популяции и их связь с заболеваниями. Дается представление о полногеномном поиске ассоциаций и консорциумных проектах, изучающих генетику рака и других заболеваний. Изучаются элементы системной биологии, показывающей как генетические изменения могут приводить к изменениям на функциональном уровне. Дается представление о метаболических и сигнальных сетях, онтологическом анализе. Изучаются ДНК-белковые взаимодействия и РНК-регуляция. Дается представление о сравнительном анализе геномов человека и ближайших видов, таких как шимпанзе или неандерталец.
Цель освоения дисциплины
- Познакомиться с базами данных ортологов и знакомство с 3-х мерной структурой белков по базе данных PDB.
- Освоить программу визуализации трехмерной структуры белка PyMol.
- Научиться выстраивать филогенетические деревья на примере коровых белков (ATP, DNA-poymerase, 16S-RNA). Программа MEGA.
Планируемые результаты обучения
- Знать организацию геномов прокариот и эукариот
- Понимание эволюции коронавируса SARS-Cov.
- Определять молекулярный механизм действия ферментов разного класса.
Содержание учебной дисциплины
- Введение в геномику человека.
- Генотип и гаплотип.
- Исследования GWAS.
- Сравнительная геномика человека и шимпанзе.
- Неандерталец и денисовец.
- Генетика здоровья.
- Генетическая генеалогия и исследование популяций.
- Генетика рака.
- Анализ генной онтологии.
- Вторичные структуры ДНК.
- Вторичные структуры РНК.
- Транскрипционные факторы и мотивы.
- Метагеномика.
Элементы контроля
- Квизы
- Домашнее задание
- ЭкзаменЭкзамен является блокирующим (при отсутствии автомата).
Промежуточная аттестация
- 2025/2026 4th moduleНАКОП=0.3*(среднее по квизам)+0.3*(среднее по ДЗ) +0.4*экзамен Экзамен является блокирующим (при отсутствии автомата).
