Магистратура
2025/2026
Биоинформатика растений
Статус:
Курс обязательный (Клеточная и молекулярная биотехнология)
Кто читает:
Базовая кафедра Института биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН
Где читается:
Факультет биологии и биотехнологии
Когда читается:
2-й курс, 1, 2 модуль
Охват аудитории:
для своего кампуса
Язык:
русский
Кредиты:
6
Программа дисциплины
Аннотация
Целью данной дисциплины является приобретение практических навыков анализа транскриптомных и геномных данных растений, используя онлайн инструменты и возможности Linux, для построения системных моделей биологических процессов. Студент после освоения курса будет понимать фундаментальные понятия, законы, теории постгеномной биологии, задачи биоинформатического анализа и его связь с другими науками, принципы работы современных баз данных.
Цель освоения дисциплины
- Получение теоретических знаний и практических навыков поиска и обработки систематизированных биологических данных с применением международных баз данных и использованием современных подходов в области структурной и системной биоинформатики. Знакомство с алгоритмами основных биоинформатических подходов и их применением для решения актуальных задач генетики, биотехнологии и селекции.
Планируемые результаты обучения
- Знание характеристик отдельных антибиотиков, применяемых для защиты растений. Освоение способов применения антибиотиков для защиты растений. и способов применения антибиотиков для стимуляции роста растений.
- Проводит поиск и анализ данных (в том числе с использованием методов биоинформатики), научной литературы для достижения поставленной цели научного исследования
- Организует закладку полевых и лабораторных опытов в рамках испытания растений и влияния условий на проявление их признаков и свойств
- Производит учеты и наблюдения в опытах для испытания растений с оценкой влияния условий на проявление признаков и свойств
- Определяет комплекс традиционных и современных (полевых и лабораторных) методов исследования для решения научных задач
Содержание учебной дисциплины
- Тема 1. Базы данных
- Тема 2. Сравнение последовательностей
- Тема 4. Методы определения пространственной структуры биополимеров
- Тема 5. Предсказание функции биополимеров по последовательности
- Тема 6. Эволюция на уровне молекул
- Тема 3. Уровни структурной организации белков
- Тема 7. Актуальные проблемы биоинформатики
Элементы контроля
- Работа на семинарах, доклад по презентацииРабота на семинарах в форме доклада с презентацией 5 минут и 5 минут ответы на вопросы. При подготовке презентации группой студентов, должна быть возможность сделать доклад каждым студентом
- Экзамен
- ТестТест содержит 10 вопросов, каждый по одному баллу.
Промежуточная аттестация
- 2025/2026 2nd module0.2 * Работа на семинарах, доклад по презентации + 0.2 * Тест + 0.6 * Экзамен
Список литературы
Рекомендуемая основная литература
- Alice in the Land of plants : biology of plants and their importance for planet Earth, Manetas, Y., 2012
- Margaret M. Lock. (2002). Twice Dead : Organ Transplants and the Reinvention of Death. University of California Press.
- Анатомия и морфология растений : 2019-08-27 / составитель А. Н. Лободяников. — Белгород : БелГАУ им.В.Я.Горина, 2018. — 56 с. — Текст : электронный // Лань : электронно-библиотечная система. — URL: https://e.lanbook.com/book/123343 (дата обращения: 00.00.0000). — Режим доступа: для авториз. пользователей.
- Анатомия растений. Методические указания по изучению дисциплины и задания для контрольных работ : методические указания / составитель Е. В. Митина. — Орел : ОрелГАУ, 2014. — 41 с. — Текст : электронный // Лань : электронно-библиотечная система. — URL: https://e.lanbook.com/book/71252 (дата обращения: 00.00.0000). — Режим доступа: для авториз. пользователей.
- Ботаника. Морфология и анатомия высших растений : учебник для вузов, Лотова, Л. И., 2020
- Замотайлов, А. С. Актуальные проблемы интегрированной экологизированной и биологической защиты растений от вредителей : учебное пособие / А. С. Замотайлов. — 2-е изд., испр. и доп. — Краснодар : КубГАУ, 2019. — 115 с. — ISBN 978-5 00097-955-6. — Текст : электронный // Лань : электронно-библиотечная система. — URL: https://e.lanbook.com/book/171581 (дата обращения: 00.00.0000). — Режим доступа: для авториз. пользователей.
- Кириллович, Н. Н. Plants, Forests and Forest operations : учебное пособие / Н. Н. Кириллович. — Екатеринбург : УГЛТУ, 2020. — 93 с. — ISBN 978-5-94984-746-6. — Текст : электронный // Лань : электронно-библиотечная система. — URL: https://e.lanbook.com/book/157284 (дата обращения: 00.00.0000). — Режим доступа: для авториз. пользователей.
- Сумма биотехнологии : руководство по борьбе с мифами о генетической модификации растений, животных и людей, Панчин, А. Ю., 2022
Рекомендуемая дополнительная литература
- Invasive and introduced plants and animals : human perceptions, attitudes and approaches to management, , 2013
- Агротехника выращивания древесных растений в питомнике : учебно-методическое пособие - 978-5-7038-5152-4 - Савченкова В. А. - 2019 - Москва: МГТУ им. Н.Э. Баумана - https://ibooks.ru/bookshelf/374753 - 374753 - iBOOKS
- Винаров, А. Ю. Агрохимия: системный анализ и компьютеризация принятия решений оптимального выбора биодобавок для роста растений : учебник для вузов / А. Ю. Винаров, В. В. Челноков, Е. Н. Дирина. — 3-е изд., перераб. и доп. — Москва : Издательство Юрайт, 2025. — 199 с. — (Высшее образование). — ISBN 978-5-534-14928-9. — Текст : электронный // Образовательная платформа Юрайт [сайт]. — URL: https://urait.ru/bcode/564368 (дата обращения: 04.07.2025).
- Дурное семя : удивительная история жалящих, обжигающих и убивающих растений, Астафьефф, К., 2022
- Терехова, Н. А. Актуальные проблемы биологии и экологии растений : учебно-методическое пособие / Н. А. Терехова, А. Н. Ершова. — Воронеж : ВГПУ, 2023. — 92 с. — Текст : электронный // Лань : электронно-библиотечная система. — URL: https://e.lanbook.com/book/340241 (дата обращения: 00.00.0000). — Режим доступа: для авториз. пользователей.